Несмотря на небольшие размеры островов, более двух дюжин природоохранных зон защищают местную флору и фауну. Более 230 разновидностей животных и 1370 видов растений, преимущественно аридных (их них 120 эндемичных), населяют эту землю. Гранд-Инагуа (Большой Инагуа) является превосходным местом для наблюдения за птицами, а Национальный парк Инагуа защищает наибольшее в западном полушарии скопление западного (индийского) фламинго. Также богатым живым миром славятся заповедники Национальный парк Абако, риф Мэн-O-Вар (Абако-Кэй), охраняемая область вокруг Лав-Хилл на северо-восточном побережье Норд-Андрос и Эмбристер-Крик к северу от Нью-Харбор на острове Кэт-Айленд.