Две основные авиакомпании - Olympic Air (наследница прекратившего свое существование три года назад национального перевозчика Olympic Airlines) и Aegean Airlines - выполняют регулярные рейсы по всей стране, включая большинство островов. Некоторые рейсы являются дотационными и их цены относительно невысоки и не меняются в течении всего года, например Родос - Мегисту, Афины - Лесбос, Карпатос - Афины.