Железнодорожное сообщение (www.kereta-api.com) отлично развито только на острове Ява, плюс два небольших отрезка существуют на Суматре. Для туриста путешествие на поезде может быть полезным и актуальным при переездах из Джакарты в другие мегаполисы Явы (Семаранг, Сурабая и Джокьякарта). Вместе с тем стоимость проезда в поезде, а особенно в первом классе спального вагона, соответствует авиаперелету бюджетной авиакомпанией. Поездка на поезде, скажем, из Джакарты в Джокьякарту (12 часов пути) оправдана только в случае, если турист путешествует самым дешевым классом. При этом поездка на автобусе будет стоить примерно на треть дешевле поезда, а время в пути составит не более 8 часов.